BİLİMSEL ÇALIŞMA & ARAŞTIRMA
YAYINLANMIŞ BİLİM EBOOKS
From what we know, the human eye is anything but simple. Though it may look like nothing more than merely a white sphere with a central coloured ring at its anterior that encircles a small dark opening, that is just the tip of the iceberg. Within this hollow, 6-cubic-centimetre globe is over two million interacting parts that work to ensure light is gathered and processed into visual information as smoothly as possible. Its enormous complexity relative to its small size is the reason that the eye is considered the second most complex organ in the human body after the brain. This gorgeous, highly resilient organ can adjust accordingly to changing conditions and environments within a matter of milliseconds. The human eye is incredibly productive, working nonstop to manipulate the laws of physics by altering the trajectories and angles of incoming electromagnetic radiation, initiating biochemical pathways in our retinae to form visual details that biologically make sense. The fact that light entering our eyes from all different directions and distances is focused and projected onto our retinae as a clear, 2D image, and then information from that 2D image is used in our brain to construct 3D images that allow us to perceive the world in three dimensions is truly a work of genius by nature. Even the muscles that surround the bulb of the eye and regulate its movements are the swiftest and most powerful muscles in the human body relative to their function. Just like how the eye is the window to the outside world, this book is a window into the anatomical structures that form this biological powerhouse of energy-converting cells that help us discern vision.
Birçok araştırma çalışması, DNA hipermetilasyonunun, Von Hippel-Lindau (VHL) olarak bilinen önemli tümör baskılayıcı genlerin transkripsiyonel susturulması yoluyla berrak hücreli renal hücreli karsinomların (ccRCC) gelişimiyle bağlantılı olduğunu göstermiştir. Bu çalışmaların sonuçları beni şu soruyu sormaya yöneltti: "Hipometile edici ajanlar, bu genlerin transkripsiyonel aktivitesini yeniden aktive etmek için VHL tümör baskılayıcı genlerin hipermetile edilmiş H3K4me1 işaretlerini demetile etmek için kullanılabilir mi?" Bu, tüm teklifin dayandığı sorudur. Hipometile edici ajanların VHL genlerini yeniden etkinleştirdiği kesin moleküler mekanizmaları ortaya çıkarmak için MeDIP, RT-qPCR ve Western Blot gibi test yöntemlerini içeren kılavuzlu bir yaklaşımın ardından, bu sahte NIH Hibe Önerisi, esasen bu konudaki potansiyel araştırma alanları için bir şablon görevi görür. ccRCC'nin daha fazla gelişmesini ve ilerlemesini baskılamada hipometile edici ajanların etkinliğini belirlemek için alınabilecek konu ve yaklaşımlar. Başarılı olursa, bu epigenetik tabanlı terapötik teknik, malignitenin ileri evreleri için potansiyel olarak ilk makul tedavi olabilir.
Dünya'da görülebilen muazzam biyolojik çeşitliliğin nedenini düşünmek için hiç durup düşündünüz mü? Ya da neden bazı organizmaların hayatta kalıp genlerini bir sonraki nesle aktarırken bazılarının bunu yapmadığını hiç merak ettiniz mi? Bu sorular, Dünya'nın evrim tarihi boyunca var olan hemen hemen her türü etkileyen ve gezegenin tüm ekosistemlerinde sürekli olarak rol oynayan, görünüşte ince ama güçlü bir doğal fenomen olan Evrim tarafından ele alınabilir. Evrim tek bir güç değil, daha çok türlerdeki değişimi hep birlikte yönlendiren güçlerin bir araya toplanmasıdır - en belirgin şekilde genetik mutasyonlar, Doğal Seçilim ve Yapay Seçilim. Bu kuvvetlerin her biri esas olarak genlerin kalıtımının arkasındaki bilime ve bir organizmanın genotiplerinin onun fenotipik özelliklerini nasıl belirlediğine dayanmaktadır. Dünyanın evrimsel tarihi boyunca, Doğal Seçilim, mutasyonlar nedeniyle DNA'da meydana gelen değişikliklerin bir sonucu olarak organizmaların farklı hayatta kalmalarını ve üremelerini doğrudan etkilemiş, belirli özellikleri diğerlerine tercih ederek belirli türlerin hayatta kalmasına ve diğerlerinin ölümüne neden olmuştur. . Evrimin çoğu doğal güçlerden etkilenmiş ve etkilenmiş olsa da, insanlar tarafından Gen Düzenleme ve Genetik Mühendisliği tekniklerinin (CRISPR gibi) geliştirilmesi bize türlerin evrimini yapay olarak etkileme gücü veriyor. Yapay Seçilim yoluyla, organizmalarda arzu edilen özelliklerin sıklığını ihtiyaçlarımıza uyacak şekilde artırmak için yeni genleri değiştirebilir veya yaratabiliriz - hatta muhtemelen mevcut yok olma krizini çözebiliriz. İster genetik mutasyonların ardındaki mekanizmalar veya Doğal ve Yapay Seçilim'in altında yatan süreçler hakkında daha fazlasını öğrenmeye hevesli olun, ister sadece Evrim hakkındaki bilginizi genişletmenin peşinde olun, bu kitapta her şey var!
Proteinler, Dünya Gezegeninde var olan her canlı organizmanın her hücresinin hemen hemen her hücresel bileşenini oluşturan gerçekten harika biyolojik moleküllerdir. Bunlar, Moleküler Biyolojinin Merkezi Dogmasının nihai ürünleridir ve Transkripsiyon ve Çevirinin karmaşık süreçlerinin bir sonucu olarak sentezlenirler. Proteinler, hücreler arasında kimyasal sinyaller göndermekten kimyasal reaksiyonları katalize etmeye kadar organizmaların vücutlarında çok sayıda işlevi yerine getirmelerini sağlayan çeşitli şekil ve boyutlarda gelir. Yapı ve işlevdeki bu çeşitlilik, nihayetinde proteinlerin monomerleri olan amino asitlerin temel dizilişinden ve düzenlenmesinden kaynaklanmaktadır. Dünyadaki çoğu yaşamın temeli olarak hizmet eden hayati molekül olan DNA'nın hücrelerde protein üretmesi gerekmesine rağmen, proteinin kendisi aslında Dünya'daki yaşamın evrimsel zaman çizelgesinde DNA'dan önce geldi. Sonuç olarak, DNA ve dolayısıyla yaşam, protein olmadan var olamaz. Bu kitap, nasıl sentezlendikleri, yapısal seviyeleri ve organizmaların en iyi şekilde çalışmasını sağlamak için gerçekleştirdikleri farklı işlevler dahil olmak üzere proteinlerin büyüleyici dünyasını araştırıyor.
Küresel nüfus benzeri görülmemiş bir oranda artmaya devam ederken ve yenilenemeyen enerji üretimi giderek daha sürdürülemez hale gelirken, dünyamız eşi benzeri olmayan bir enerji kriziyle karşı karşıya. Sonuç olarak, temiz, sürdürülebilir, yenilenebilir enerji üretme ihtiyacı her zamankinden daha önemli - ticari ve ekonomik olarak uygulanabilir nükleer füzyon enerji santrallerinin geliştirilmesiyle elde edilebilecek bir şey. General Fusion şirketinin kurulmasının nedeni tam olarak budur — endüstriyel ölçekte füzyon enerjisi kullanılarak elektrik üretiminin uygulanmasına izin vermek. Bu kitap, General Fusion'ın teknolojisini, şirketin nihai vizyonunu, elektrik üretim sürecini ve çok daha fazlasını sergilemek ve ilerletmek için geliştirdiği benzersiz yöntemi ele alıyor! Küresel enerji endüstrisinde devrim yaratma potansiyeline sahip bir aday olan General Fusion kesinlikle öğrenmeye değer (özellikle burada Dünya üzerinde yapay bir güneşin nasıl inşa edilebileceğine dair biraz bilgi edinmek isteyenler için).
Uyuşturucuları bu kadar özel yapan şeyin ne olduğunu hiç merak ettiniz mi? Veya daha geçen yüzyılda ilaçların kurtardığı inanılmaz sayıda hayat üzerine hiç düşündünüz mü? Alexander Fleming'in 1928'de streptokok menenjitini tedavi etmek için penisilini (ilk antibiyotik) keşfetmesinden, kimya ve biyolojinin harikaları, farmakologların bakteriyel, viral, fungal ve paraziter enfeksiyonların en ölümcül bazılarına karşı tedaviler geliştirmesine olanak sağlamıştır. COVID-19 Pandemisini sona erdirmek için SARS-CoV-2'ye karşı hızlı antiviral geliştirme, farmakoloji dünyası son 100 yılda hızla gelişti. Bu kitap, ilaçların nasıl sınıflandırıldığı ve adlandırıldığı, ilaçları bir kez tükettiğimizde vücudumuzun nasıl etkilediği ve ilaçların yutulduktan sonra bizi nasıl etkilediği dahil olmak üzere farmakolojiye yeni başlayanlar için bir rehber görevi görüyor.
Tıbbın geleceğini değiştirebilecek gerçekten yenilikçi tedavi teknikleri var ve bunlardan biri de anti-VEGF. Bu anti-anjiyojenik terapi, VEGF sinyal yollarını baskılayabilen biyomoleküller kullanılarak daha önce tedavi edilemeyen çeşitli kanserleri ve retina hastalıklarını tedavi edebilir, böylece kanserlerde metastazı ve retina hastalıklarında geri dönüşü olmayan körlüğü önleyebilir. 21. yüzyılın başlangıcından bu yana, Bevacizumab, Ranibizumab ve Aflibercept gibi çeşitli anti-VEGF monoklonal antikor tedavileri ve Sunitinib, Sorafenib ve Pazopanib gibi Tirozin Kinaz İnhibitörleri olarak bilinen başka bir tedavi şekli geliştirilmiş ve dağıtılmıştır. ancak bu tedavilerin etkinliğini arttırmak için daha fazla araştırma ve deney yapılması gerekmektedir. Bu bilgilendirici tıbbi el kitabı, yaygın anti-VEGF tedavilerini ve bunların moleküler seviyedeki etki mekanizmalarını açıklamadan önce, VEGF'nin kanserin çoğalmasında ve retinal hastalık ilerlemesinde oynadığı rolü açıklamaktadır. yeni tıbbi yenilikler hakkında daha fazla bilgi edinin, hevesli bir tıp bilimcisi veya kalifiye bir doktor - anlayabilir. El kitabı aynı zamanda anti-VEGF tedavileri konusunda tıbbi makaleler yazmak isteyen tıp araştırmacıları için kapsamlı bir referans sağlamayı amaçlamaktadır ve bu nedenle bu tür kişiler için şiddetle tavsiye edilmektedir.
Evren, yalnızca birkaç fiziksel formül veya kanunla açıklanamayacak, algılanamayan doğa harikalarıyla doludur ve karanlık enerji de bir istisna değildir. Bu kitap, kozmosu sürekli artan bir hızla genişlemeye zorlayan bu güçlü, görünmez güce -keşfi, hakkında bildiklerimiz, evren üzerindeki etkisi, oluşabileceği teorik parçacıklar, matematiksel kuvveti açıklayabilecek denklemler ve daha fazlası. İster gelecek vadeden bir astrofizikçi olun, ister evren hakkında daha fazla şey öğrenmek isteyen bir astronomi meraklısı olun, ister sadece bir kitap aracılığıyla evrene seyahat etmek isteyin, o zaman Dark Energy 101 sizin için mükemmel!
BİLİMSEL ÇALIŞMA & ARAŞTIRMA
The Role of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) in Tumour Angiogenesis and Anti-Angiogenic Therapeutic Methods to Treat Cancer and Various Retinal Diseases
Abstract
Tumour cells have a high oxygen and nutrient demand, and thus require a constant blood supply to survive and proliferate. As a result, they secrete abnormally high amounts of a cytokine called Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) to stimulate the formation of new blood vessels from pre-existing ones - a process known as angiogenesis – to acquire an adequate blood supply. This process involves a signalling pathway that begins with VEGF molecules binding to VEGF Receptors (VEGFR) on vascular endothelial cells in blood vessels, which leads to conformational changes in the receptors, then intracellular signal transduction by second messengers, and finally, the activation of the gene that is responsible for blood vessel growth. This vasculature that forms around malignant tumours not only allows for the expansion of the tumour tissue, but, even more concerningly, can lead to metastasis. Therefore, tumour angiogenesis plays a crucial role in the spread of cancer throughout the body, which could kill a patient within months. However, the special characteristics of the molecular mechanisms underlying this signalling pathway offer unique therapeutic opportunities, which is why many scientists today are researching and developing potential treatments to inhibit tumour angiogenesis by targeting certain checkpoints in the pathway. By inhibiting malignant tumour cells from receiving an adequate blood supply, it will be possible to prevent further cancer growth, proliferation, and metastasis from occurring. This same angiogenic pathway can alsoresult in ocular angiogenesis, which is responsible for the cause and progression of many retinal diseases, in which high vascular permeability is particularly an issue of concern.
The Use of Hypomethylating Agents as a Therapeutic Against DNA Hypermethylation in ccRCC
Abstract
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is driven in large part by an epigenetic mechanism: hypermethylation of CpG islands in promoter and enhancer regions silences the Von Hippel-Lindau (VHL) tumor suppressor gene, removing a critical brake on tumor growth. This proposal investigates whether hypomethylating agents can reverse that silencing and serve as a viable therapeutic for ccRCC. Specific Aim 1 examines the precise molecular mechanisms by which these agents demethylate H3K4me1 marks at VHL enhancer regions, using Methylated DNA Immunoprecipitation (MeDIP) to map where and how much demethylation occurs. This aim also tests whether hypomethylating agents can reactivate WIF-1, a Wnt pathway antagonist, to suppress the overactive Wnt signaling that drives proliferation and migration in renal cancer cells, with RT-qPCR used to quantify changes in gene expression and Western blotting used to compare tumor suppressor and oncogene protein output. A notable complication is that these agents appear to simultaneously reactivate select oncogenes (Interleukin-8, G250, CYTIP, and HLA-G), and this proposal aims to understand why, with the goal of eventually designing agents that act selectively on VHL without these off-target effects. Specific Aim 2 evaluates the physiological impact of hypomethylating agents on kidney function in ccRCC patients, tracking glomerular filtration rate, electrolyte balance, and blood pressure, and comparing prognostic outcomes against a placebo control group. Since no epigenetic-based therapeutic currently exists for renal cell carcinoma, and advanced-stage disease still lacks an effective cure, this work could open a new treatment pathway for a cancer that accounts for roughly 4% of adult malignancies worldwide, while also laying groundwork for epigenetic therapies in other cancers.
İNDİRİLEBİLİR BİLİM BİLGİLERİ VE ŞEMALARI
BİLİM VİDEOLARI/ANİMASYONLARI
COVID-19 mRNA Aşısı Nasıl Çalışır?
Endotrakeal Entübasyonun 4 Adımı 20 Saniyede Gösterildi ve Açıklandı
5 Adımda Gösterilen ve Açıklanan Kan Tayini İşlemi
1 dakikalık COVID-19 mRNA Aşısı Özet Animasyonu
Past and Future of the Universe Through the Lens of Dark Energy
SCIENTIFIC PRESENTATIONS
LABORATUVAR RAPORLARI
Articles on Innovation Hub
Innovation Hub is an international youth-led science magazine and online platform publishing scientific articles written by high school students, based out of Warsaw, Poland. I've written two articles for them, both in their Biology section: "VEGF's Role in Tumour Angiogenesis and Novel Anti-Angiogenic Drugs to Treat Cancer & Retinal Disease" and "The Differences Between Male & Female Bodies in Humans".